Zamijenite težak život ubojice i pređite na drugu stranu k templarskim braćama i njihovoj ideologiji, koja nastoji među stanovništvom uspostaviti red i harmoniju svakodnevnog života. Sve to i uz gubitak slobode i nekih ljudskih prava. Igrat ćete za junaka Shaya, koji nakon neuspjele akcije okreće leđa ostalim ubojicama i nakon pokušaja njegova ubojstva trajno prelazi k njihovim najvećim neprijateljima, templarima. Priča igre smještena je na apačkoj teritoriji u Sjevernoj Americi, gdje se suprotstavljaju dvije zavađene vojske — Francuzi i Britanci, kojima u borbama pomažu indijanski saveznici.

Junak će, osim saveznika, promijeniti i način naoružanja, koji se zasniva na učinkovitoj vatrenoj pušci, upotrebljivoj i na daljinu i za borbu izbliza. Osim puške, moći ćete svoje protivnike likvidirati ili zbuniti, primjerice pomoću petardi, ili ih privući i ugušiti pomoću ispaljivog užeta. Veliku važnost ovdje imaju i borbe na brodovima, koje se odvijaju u sjevernim vodama, a bit će tu i mogućnost probijanja u unutrašnjost pomoću riječnih tokova.

Prilikom istraživanja unutrašnjosti čuvajte se vrebajućih ubojica, koji vas od početka imaju na meti i neće se smiriti dok vas ne dohvate. Po zgradama ćete se moći penjati samo u jedinom velikom gradu — New Yorku. Igra je posebno dizajnirana za starije igraće konzole PlayStation 3 i Xbox 360.