Crysis 3 nastavlja radnju drugog dijela u trenutku, kada se u ulozi vojnika nađete u New Yorku u svom odijelu nanosuit. Crysis 3 odvija se pretežno u gradskom okruženju New Yorka, koji je napadnut izvanzemaljcima i u 2047. izgleda znatno drugačije. Uništenu okolinu prekriva rastinje, šume i duboke močvare, grad odavno ne funkcionira i u potpunosti je zatvoren od strane organizacije Cell Corporation. Svi ljubitelji pucačina doći će na svoje; bit će im na raspolaganju tone oružja i tehnologije, kako zemaljske tako i izvanzemaljske. Za vizualni izgled pobrinut će se nova tehnologija CryENGINE, koja će se iskazati u sedam osnovnih vrsta okruženja. Jasno je da se ne radi samo o običnoj nadogradnji drugog dijela, već o punokrvnom djelu na koje se možemo veseliti.