Svestrani Joy-Con kontroleri nude mnogo mogućnosti i sjajna iskustva igranja. Joy-Con kontroler moguće je koristiti samostalno u jednoj ruci, samostalno u obje ruke, ili kao igraći kontroler umetnut u Joy-Con grip.
Iskoristite ih za samostalno igranje, ili ih podijelite s prijateljima i igrajte u multiplayer načinu. Svaki od Joy-Con kontrolera ima vlastiti skup tipki i punopravni je kontroler; također je opremljen akcelerometrom i žiroskopskim senzorom pokreta, što mu omogućuje neovisno upravljanje desne i lijeve strane.
Lijevi Joy-Con kontroler uključuje i tipku Capture, koja igračima omogućuje snimanje najboljih trenutaka igranja i dijeljenje s prijateljima putem društvenih mreža. Desni Joy-Con dolazi s NFC modulom za interakciju s Amiibo figuricama.
Također sadrži IR kameru pokreta koja može otkriti udaljenost, oblike i kretanje bliskih objekata.
Na primjer, može odrediti gdje se nalazi ruka igrača i kakav oblik tvori. Joy-Con kontroleri također imaju naprednu funkciju HD Rumble, koja u kompatibilnim igrama omogućuje igračima da osjete realistične vibracije. Ovaj efekt je vrlo detaljan i omogućuje igračima da osjete i veoma suptilne vibracije, poput vibracija pojedinačnih kockica leda u čaši, koje Joy-Con kontroler može simulirati. Zahvaljujući ovoj funkciji, igrači će osjetiti stvarne detalje koje ne mogu postići samo vidom i sluhom.