Pripremite se na pustolovinu na otoku s Mariom i Luigijem u glavnim ulogama!
Braća se vraćaju kako bi doživjeli potpuno novu pustolovinu na otvorenom moru! Krenite s Mariom i Luigijem na otok Shipshape, koji je djelomično sastavljen od brodova, i proputujte prostrani svijet Concordia. Ispalite se iz topa broda Shipshape i pronađite put kroz otoke koji se protežu od tropskih kišnih prašuma do užurbanih gradova. Čeka vas pregršt istraživanja!
Na putu ćete sresti nove prijatelje poput Connie i Snoutleta (koji zasigurno nije svinja) kao i poznata lica iz Mushroom Kingdoma – Peach i Bowsera. Svi oni će vam pomoći na vašem putovanju!
Da biste uspjeli, morat ćete se osloniti na bratsku vezu Maria i Luigija. Za savladavanje prepreka u istraživanju koristite snažne tzv. Bros. Attacks u okviru dinamičnih poteznih borbi. Za spašavanje će vam trebati svaka prednost koju vam to "bratstvo" pruža!