U dalekoj budućnosti otkriven je psionski hormon u ljudskom mozgu koji ljudima omogućuje psihičke moći, što je promijenilo cijeli poznati svijet. U trenutku kada je čovječanstvo zakoračilo u novu eru, pojavili su se mutanti nazvani Others, koji žude za ljudskim mozgom. Mutanti su vrlo otporni na uobičajeno konvencionalno oružje, pa su poduzete posebne mjere kako bi se suprotstavili ovoj dosad neviđenoj prijetnji koja ugrožava čovječanstvo. Scarlet Nexus je prekrasno stilizirana akcijska igra s inovativnim borbenim sustavom punim nadnaravnih sposobnosti.
Korištenje psihokinetičkih vještina postalo je najmoćnije oružje diljem svijeta. Podizanje, razbijanje i bacanje dijelova okoliša te tako stvaranje snažnih napada i komboa jedini su načini kako poraziti moćnog neprijatelja.
Izopačeni mutanti koji su sišli s neba, izrazito otporni na konvencionalne napade i obranu, odlučili su opustošiti svijet. U stalnoj su agoniji prouzrokovanoj mutacijom i zato traže mozgove živih organizama koji će umiriti njihovu ludost. U ovom futurističkom Japanu kombinira se inspiracija iz klasičnih anime i zapadnjačkih sci-fija u žanr nazvan Brain Punk.
U igri preuzimate ulogu Yuita Sumeragija iz jedinice Other Suppression Force (OSF). Postupno ćete se opremiti svojim psihokinetičkim talentom, istražit ćete futuristički grad New Himuka i otkriti tajne Brain Punka budućnosti. Iza priče stoje ljudi koji su stvorili igru Tales of Vesperia, pa se možete radovati složenoj priči punoj hrabrosti, junaštva, ali i međuljudskih odnosa.