U dalekoj budućnosti otkriven je psionski hormon u ljudskom mozgu koji ljudima omogućuje izvanosjetilne moći, što je promijenilo cijeli poznati svijet. U trenutku kad je čovječanstvo ušlo u novu eru, pojavili su se mutanti nazvani Others, koji žude za ljudskim mozgom. Mutanti su vrlo otporni na uobičajeno konvencionalno oružje, pa su poduzete posebne mjere za borbu protiv ove dosad neviđene prijetnje čovječanstvu. Scarlet Nexus je lijepo stilizirana akcijska igra s neobičnim borbenim sustavom punim nadnaravnih sposobnosti.
Korištenje psihokinetičkih vještina postalo je najveće oružje diljem svijeta. Podizanje, razbijanje i bacanje dijelova okoline i izgradnja snažnih napada i komba jedini su način da se pobijedi moćni neprijatelj.
Iskrivljeni mutanti sišli su s neba; vrlo otporni na konvencionalne napade i obranu, odlučili su poharati svijet. U stalnoj su agoniji uzrokovanoj mutacijom i zato traže mozgove živih organizama koji bi umirili njihovu ludost. U ovom futurističkom Japanu kombiniraju se inspiracije iz klasičnih anime i zapadnjačkih znanstveno-fantastičnih djela u žanr nazvan Brain Punk.
U igri preuzimate ulogu Yuita Sumeragija iz jedinice Other Suppression Force (OSF). Postupno ćete razvijati svoj psihokinetički talent, istražiti futuristički grad New Himuka i otkriti tajne Brain Punk budućnosti. Iza priče stoje ljudi koji su stvorili igru Tales of Vesperia, pa se možete radovati složeno ispričanoj priči punoj hrabrosti, junaštva, ali i međuljudskih odnosa.