A Tales of Xillia Jude Mathis, egy fiatal orvostanhallgató és Milly Maxwell, egy titokzatos nő történetét követi, akit 3 láthatatlan alak kísér. Kalandjuk kezdetén a játékosok választanak egyet a hősök közül. A játék RIEZ MAXI világában játszódik, ahol emberek és szellemek harmóniában élnek együtt. Rashugal királysága egy hatalmas eszközzel kísérletezik, amely elszívja a világból a szükséges manát. Milla és Jude felismerik, hogy ez az erős, pusztító eszköz milyen veszélyt jelent a világra, és nekivágnak egy ijesztő feladatnak: elpusztítják az eszközt, és visszaadják a manát a világnak, ahová való. A világ megmentésére irányuló küldetésük során Milla és Jude a RIEZ MAXI világának számos szereplőjével találkozik, akik segítenek nekik a rettentő feladatban.