UFO: Aftershock - története az első epizód egyik alternatív befejezését követi, ahol a Földet idegen tudósokra bízták, akik egyetlen óriási élő organizmussá akarják változtatni a Földet. A Földi Tanács és támogatói ekkor egy Föld körül keringő műholdon telepednek le. Ám nem mindenki akarta feladni a hazáját, és az idegenek által előkészített műholdra költözni. A darab cselekménye akkor kezdődik, amikor az emberiség egy része a műholdon él. Bár nincs jele az idegenek jelenlétének, arról sincs hírük, hogy mi történik a Földön. Így a mi bolygónkra kell utazniuk, hogy kiderítsék az események körülményeit, és hogy a Földön maradt emberek hogy vannak.

A folytatás számos újdonságot és fejlesztést kínál. A legnagyobb újdonság talán a bázisépítés és az erőforrás-kezelés megvalósítása, ami az első játékban a játékosok vágyálma volt. Emellett új típusú ellenségekre, fegyverekre, továbbfejlesztett harcrendszerre és egy rakás új felfedezendő technológiára is számíthatunk.

Min. konfiguráció:
Win 2000/XP, 1 GHz-es CPU, 512 MB RAM, GeForce 5700/Radeon 9500 grafikus kártya, 4 GB lemezterület.