Išlo je već 20 godina otkako su svjetski čelnici dobrovoljno podlegli vladavini vanzemaljskih snaga, a XCOM, posljednja obrambena linija čovječanstva, bio je prepušten na milost i nemilost propasti. Svijet se promijenio do neprepoznatljivosti!

Sada Zemljom vladaju vanzemaljci i brzo se upuštaju u izgradnju zapanjujućih gradova koji su obećanje bolje budućnosti za čovječanstvo. No ništa nije tako savršeno kako se čini na prvi pogled — vanzemaljci imaju tajanstven, strašan cilj. Oni koji pokušaju prkositi, teško će platiti.

Samo oni koji nastanjuju rubove svijeta mogu se radovati obećanju slobode. Upravo u tim krajevima ljudi pokušavaju ponovno prikupiti snagu i okupiti vojsku koja će se boriti za interese čovječanstva.

Ostatci specijalnih jedinica XCOM-a moraju pronaći način kako se podići iz pepela i ponovno ojačati, pokušati otkriti strašnu istinu koja se krije iza okupacije i zauvijek eliminirati vanzemaljsku prijetnju.